¡Hola takoyaki15, bienvenido!
Vamos por partes:
Particionado entre los dos discos
Con un NVMe (más rápido) y un SATA SSD (más lento), lo más habitual es:
NVMe (1TB): sistema completo (/), ahí es donde más se nota la velocidad — arranque, apps, compilación si programas.
SATA SSD (2TB): /home como partición separada, montado ahí. Ideal para proyectos, juegos instalados (Steam), librerías de emulación, etc. — cosas que pesan pero no necesitan la velocidad máxima del NVMe.
Para tu caso (dev + gaming), yo montaría / en el NVMe y /home en el SATA. Si luego quieres separar aún más (por ejemplo, tener la carpeta de Steam en el NVMe para tiempos de carga mejores en Halo), puedes montar un subdirectorio específico ahí con un bind mount, pero para empezar no compliques la instalación.
Btrfs vs Ext4
Para tu perfil, yo recomendaría Btrfs:
Snapshots automáticos (con Timeshift o similar) — si algo rompe tras una actualización, vuelves atrás en segundos. Muy útil cuando estás aprendiendo Linux.
Compresión transparente (zstd) — ahorra espacio sin coste real de rendimiento.
Subvolúmenes, útil para separar /home, /var, etc. si más adelante quieres afinar.
Sobre lo que leíste de que "afecta a los SSD": eso viene de la época de discos con TRIM problemático o configuraciones antiguas. Hoy en día con discard=async o un timer de fstrim semanal (que Soplos ya trae configurado), no hay ningún problema real de desgaste en SSD/NVMe modernos, ni con Btrfs ni con Ext4. No te preocupes por eso.
Ext4 sigue siendo perfectamente válido si prefieres algo más simple y "de toda la vida", pero para tu caso (aprendiendo Linux + quieres poder deshacer cambios) Btrfs te va a dar más margen de seguridad.
Secure Boot
Sí, hay que desactivarlo para instalar. Después de la instalación:
Si vas a usar los drivers propietarios de NVIDIA (recomendado para tu RTX 2060, mejor rendimiento en juegos que con Nouveau), lo más sencillo es dejar Secure Boot desactivado. Los drivers de NVIDIA no vienen firmados por defecto, y aunque existe la opción de firmarlos tú mismo (MOK enrollment), añade complejidad extra sin mucho beneficio real para un uso de escritorio/gaming.
Si no te preocupa Secure Boot (la mayoría de usuarios de escritorio no lo necesitan salvo por políticas corporativas o algún softwar específico), déjalo desactivado y ahórrate dolores de cabeza con los drivers.
Cualquier duda durante la instalación, aquí estamos. ¡Suerte con el cambio a Linux!
